Direktoriaus pavaduotojas

Meteorologinių ir aviacinių stebėjimų skyrius

Prognozių ir perspėjimų skyrius

Hidrologinių stebėjimų skyrius

Klimato ir tyrimų skyrius

Komunikacijos ir tarptautinio bendradarbiavimo skyrius

Kibernetinio saugumo vadovas

Aviacijos saugos vadovas

Atitikties stebėsenos vadovas

Matavimų kokybės ir technikos skyrius

Informacinių technologijų skyrius

Veiklos ir projektų valdymo skyrius

Struktūra